Por el sector  público:  Director General de los Servicios Ganaderos (Presidente) y  Director de la División  Sanidad Animal. 

Por el sector privado: un delegado de la Sociedad de Medicina Veterinaria, un delegado de la Asociación Rural del Uruguay, un delegado de la Federación Rural y un delegado de las Cooperativas Agrarias Federadas (a partir de mayo de 1994).  

Alternos
Cada delegado del sector privado, deberá contar con su respectivo alterno; el que tendrá iguales derechos y atribuciones que su titular pudiendo asistir a las reuniones con voz pero sin voto y ejercer automáticamente el cargo en ausencia del titular.

En el sector público, los alternos serán los correspondientes subdirectores de las citadas Direcciones. Podrán asistir a las sesiones de la Comisión Nacional,  delegados de las instituciones que se considere conveniente su participación, los que tendrán voz pero sin voto, previa resolución de la mayoría de los integrantes de dicha Comisión.

 
Presidida por:  Director General de Servicios Ganaderos. MGAP (DGSG).

Integrada por:  Director de la División de Sanidad Animal. MGAP (DSA).

Asociación Rural del Uruguay (ARU):

                                Federación Rural (FR):

Sociedad de Medicina Veterinaria del Uruguay (SMVU):

                                Cooperativas Agrarias Federadas (CAF):

                                                  Secretaría Técnica